Unidade importante na infraestrutura de pesquisa em Imunologia, o Laboratório de Imunologia é uma unidade multiusuário com diversas plataformas que servem aos pesquisadores da Disciplina de Imunologia Clínica e Alergia e demais colaboradores, ao Serviço de Transplantes do Hospital das Clínicas da FMUSP e ao InCor. Essas plataformas oferecem assistência especializada por especialistas experientes que permitem efetuar a síntese de peptídeos, a espectrometria de massa, a biologia molecular e o sequenciamento, a bioquímica, a cultura bacteriana, a microscopia automatizada, a química de proteínas, a cultura celular e a citometria de fluxo. Também tem um biotério de experimentação animal associado.

O laboratório possui 250m2 de área e é dividido em uma área multiuso, uma área de cultura celular com nível de segurança biológica 2 (NB2), sala de biologia molecular, sala de criopreservação, sala de radioatividade, câmara escura, lavanderia e escritórios para estudantes e pesquisadores. Análises de expressão gênica, citometria de fluxo, cultura celular, bioenergética são realizadas no Laboratório. Expressão de proteínas em células HEK e E coli, purificação de proteínas por FPLC, ensaios de ELISA, eletroforese de proteínas 1D e 2D, mapeamento de epítopos por array, bem como dot blot, western blot e identificação de proteínas por espectrometria de massas, além de ensaios de inibição e dosagem de IgE alérgeno-específica.