As imunodeficiências primárias (IDPs) são um grupo heterogêneo de doenças hereditárias causadas por alterações genéticas que acarretam defeitos no funcionamento de um ou mais componentes do sistema imunológico. Originalmente vistas como doenças raras, hoje, estima-se que estejam presentes em 1 a cada 2.000 indivíduos, tornando essa área de estudo um grande desafio. O iii-INCT tem uma linha de pesquisa especial voltada para o diagnóstico, acompanhamento clínico e tratamento dos pacientes portadores dessas doenças.